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Enregistrement W2079674304 · doi:10.1118/1.4736114

WE‐C‐BRA‐09: Towards Treatment Monitoring of Tumour Radiation Response with Raman Spectroscopy

2012· article· en· W2079674304 sur OpenAlexaff
Quinn Matthews, Andrew Jirasek, AG Brolo, JJ Lum

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensUniversity of VictoriaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRadioresistanceRaman spectroscopyRadiationLNCaPIrradiationNuclear medicineBiodosimetryRadiation therapyChemistryMedicineOpticsInternal medicinePhysicsIonizing radiationCancer cellCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: To use single‐cell Raman spectroscopy (RS) and principal component analysis (PCA) for early treatment monitoring of radiation response. Methods: Two human tumour cell lines, one known to be radioresistant (H460, SF2 = 0.64) and one radiosensitive (LNCaP, SF2 = 0.27), were treated with daily 2 Gy fractions of 6 MV photons, up to a maximum total dose of 10 Gy. Irradiated and unirradiated cultures were harvested and analyzed with RS each day after the previous daily fraction, and also at 2 and 3 days after the final fraction. Single‐cell Raman spectra were acquired from 20 cells per sample with a Raman microscope utilizing a 785 nm excitation laser. All spectra (280 per cell line) were post‐processed, and the total data set for each cell line was analyzed with PCA using standard algorithms. Results: One radiation‐induced PCA component was detected for each cell line by identification of statistically significant changes in the PCA score distributions for irradiated samples, as compared to unirradiated samples, at time points after the start of radiation treatment. The radioresistant cells (H460) exhibit a strong RS molecular radiation response signature, detectable as early as 2 days after the start of treatment, of which radiation‐induced glycogen synthesis is a significant contributor. The radiosensitive cells (LNCaP) exhibit a weak molecular radiation response signature that is not correlated with the radioresistant cell response, with no contributions from glycogen. The glycogen synthesis observed in the radioresistant cells is confirmed via Western blotting to be the result of radiation‐induced activation of the phosphatidylinositol‐3‐kinase/Akt (PI3K/Akt) signalling pathway, a molecular radiation response known to promote cell survival and confer radiation resistance. Conclusions: This work supports the feasibility of using RS for early treatment monitoring of tumour radiation response, leading to personalized therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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