Identification of Residues within the Drug-binding Domain of the Human Multidrug Resistance P-glycoprotein by Cysteine-scanning Mutagenesis and Reaction with Dibromobimane
Notice bibliographique
Résumé
P-glycoprotein (P-gp) can transport a wide variety of cytotoxic compounds that have diverse structures. Therefore, the drug-binding domain of the human multidrug resistance P-gp likely consists of residues from multiple transmembrane (TM) segments. In this study, we completed cysteine-scanning mutagenesis of all the predicted TM segments of P-gp (TMs 1-5 and 7-10) and tested for inhibition by a thiol-reactive substrate (dibromobimane) to identify residues within the drug-binding domain. The activities of 189 mutants were analyzed. Verapamil-stimulated ATPase activities of seven mutants (Y118C and V125C (TM2), S222C (TM4), I306C (TM5), S766C (TM9), and I868C and G872C (TM10)) were inhibited by more than 50% by dibromobimane. The activities of mutants S222C (TM4), I306C (TM5), I868C (TM10), and G872C (TM10), but not that of mutants Y118C (TM2), V125C (TM2), and S776C (TM9), were protected from inhibition by dibromobimane by pretreatment with verapamil, vinblastine, or colchicine. These results and those from previous studies (Loo, T. W. and Clarke, D. M. (1997) J. Biol. Chem. 272, 31945-31948; Loo, T. W. and Clarke, D. M. (1999) J. Biol. Chem. 274, 35388-35392) indicate that the drug-binding domain of P-gp consists of residues in TMs 4, 5, 6, 10, 11, and 12.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».