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Enregistrement W2079709165 · doi:10.1186/s12885-015-1117-0

A functional in vitro model of heterotypic interactions reveals a role for interferon-positive carcinoma associated fibroblasts in breast cancer

2015· article· en· W2079709165 sur OpenAlexafffund
Abdel Hosein, Julie Livingstone, Marguerite Buchanan, James F. Reid, Michael Hallett, Mark Basik

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéFondation de l'Hôpital général juifJewish General Hospital
Mots-clésBreast cancerInterferonParacrine signallingCancer researchSurgical oncologyTumor microenvironmentCancer-Associated FibroblastsBiologyCytokineGene expression profilingImmunologyCancerMedicineGene expressionInternal medicineGeneReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cancer-associated fibroblasts (CAFs) play an important role in breast cancer pathogenesis by paracrine regulation of breast cancer cell biology. Several in vitro and mouse models have characterized the role of cell contact and cytokine molecules mediating this relationship, although few reports have used human CAFs from breast tumors. METHODS: Primary breast CAF cultures were established and gene expression profiles analysed in order to guide subsequent co-culture models. We used a combination of colorimetric proliferation assays and gene expression profiling to determine the effect of CAFs on the MCF-7 breast cancer cell in an indirect co-culture system. RESULTS: Using gene expression profiling, we found that a subgroup of breast CAFs are positive for a type one interferon response, confirming previous reports of an activated type one interferon response in whole tumor datasets. Interferon positive breast cancer patients show a poor prognostic outcome in an independent microarray dataset. In addition, CAFs positive for the type one interferon response promoted the growth of the MCF-7 breast cancer cell line in an indirect co-culture model. The addition of a neutralizing antibody against the ligand mediating the type one response in fibroblasts, interferon-β, reverted this co-culture phenotype. CAFs not expressing the interferon response genes also promoted the growth of the MCF-7 breast cancer cell line but this phenotype was independent of the type one fibroblast interferon ligand. CONCLUSIONS: Primary breast CAFs show inter-patient molecular heterogeneity as evidenced by interferon response gene elements activated in a subgroup of CAFs, which result in paracrine pro-proliferative effects in a breast cancer cell line co-culture model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,430
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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