Evaluation of formalin-fixed paraffin-embedded tissues from feline vaccine site-associated sarcomas for feline foamy virus DNA
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To evaluate a group of vaccine site-associated sarcomas (VSS) for the presence of feline foamy virus (FeFV) DNA, using polymerase chain reaction (PCR) methods. SAMPLE POPULATION: 50 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue blocks from VSS of cats. PROCEDURE: DNA was extracted from FFPE sections of each tumor, and regions of the gag and pol genes of FeFV were amplified by use of PCR methods, using 1 primer set for each region. Sensitivity of the method was compared between fresh and FFPE cells, using mouse kidney tissue that was injected with FeFV-infected cultured cells and using agarose-cell pellets. Results-Feline foamy virus DNA was not detected in VSS tissues. Sensitivity of the method was 10 times greater in fresh versus FFPE mouse tissues. Sensitivity of the method in fresh FeFV-infected cultured cells versus FFPE agarose-cell pellets was equal when fixation was 24 or 48 hours and 10 times greater when fixation was 72 hours or 1 week. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: A PCR-based method can be successfully applied to FFPE tissues for FeFV DNA detection. Results suggest there is no direct FeFV involvement in the pathogenesis of VSS in cats.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».