MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2079791067 · doi:10.1093/infdis/jit114

Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitor Resistance Mutations Associated with First-Line Stavudine-Containing Antiretroviral Therapy: Programmatic Implications for Countries Phasing Out Stavudine

2013· article· en· W2079791067 sur OpenAlexaff
Michele W. Tang, Soo‐Yon Rhee, Silvia Bertagnolio, Nathan Ford, Susan Holmes, Kim Sigaloff, Raph L Hamers, Tobias F. Rinke de Wit, Hervé Fleury, Phyllis J. Kanki, Kiat Ruxrungtham, Claudia Hawkins, Carole L. Wallis, Wendy Stevens, Gert U. van Zyl, Weerawat Manosuthi, Mina C. Hosseinipour, Nicole Ngo‐Giang‐Huong, Laurent Bélec, Martine Peeters, Avelin F. Aghokeng, Torsak Bunupuradah, Sherri Burda, Patricia Cane, Giulia Cappelli, Charlotte Charpentier, Anoumou Dagnra, Alaka Deshpande, Ziad El‐Khatib, Susan H. Eshleman, Joseph Fokam, Jean‐Chrysostome Gody, David Katzenstein, Donato Koyalta, Johnstone J. Kumwenda, Marc Lallemant, Lutgarde Lynen, Vincent C. Marconi, Nicolas Margot, Sandrine Moussa, Thumbi Ndung’u, Phillipe N. Nyambi, Catherine Orrell, Jonathan Schapiro, Rob Schuurman, Sunee Sirivichayakul, Davey M. Smith, María Zolfo, Michael R. Jordan, Robert W. Shafer

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesU.S. Public Health Service
Mots-clésStavudineZidovudineNevirapineEfavirenzLamivudineVirologyDidanosineReverse-transcriptase inhibitorAbacavirBiologyDrug resistanceMedicineViral loadVirusAntiretroviral therapyGeneticsViral diseaseHepatitis B virus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The World Health Organization Antiretroviral Treatment Guidelines recommend phasing-out stavudine because of its risk of long-term toxicity. There are two mutational pathways of stavudine resistance with different implications for zidovudine and tenofovir cross-resistance, the primary candidates for replacing stavudine. However, because resistance testing is rarely available in resource-limited settings, it is critical to identify the cross-resistance patterns associated with first-line stavudine failure. METHODS: We analyzed HIV-1 resistance mutations following first-line stavudine failure from 35 publications comprising 1,825 individuals. We also assessed the influence of concomitant nevirapine vs. efavirenz, therapy duration, and HIV-1 subtype on the proportions of mutations associated with zidovudine vs. tenofovir cross-resistance. RESULTS: Mutations with preferential zidovudine activity, K65R or K70E, occurred in 5.3% of individuals. Mutations with preferential tenofovir activity, ≥ two thymidine analog mutations (TAMs) or Q151M, occurred in 22% of individuals. Nevirapine increased the risk of TAMs, K65R, and Q151M. Longer therapy increased the risk of TAMs and Q151M but not K65R. Subtype C and CRF01_AE increased the risk of K65R, but only CRF01_AE increased the risk of K65R without Q151M. CONCLUSIONS: Regardless of concomitant nevirapine vs. efavirenz, therapy duration, or subtype, tenofovir was more likely than zidovudine to retain antiviral activity following first-line d4T therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Infectious DiseasesMême sujetHIV/AIDS drug development and treatmentTravaux en français237 207