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Enregistrement W2080055250 · doi:10.1186/1471-2180-9-45

RpoE fine tunes expression of a subset of SsrB-regulated virulence factors in Salmonella enterica serovar Typhimurium

2009· article· en· W2080055250 sur OpenAlexafffund
Suzanne E. Osborne, Brian K. Coombes

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaMcMaster University
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologySalmonella entericaVirulenceSalmonellaMicrobiologySerotypeEnterobacteriaceaeParasitologyVirulence factorPathogenicity islandBacteriaGeneticsGeneEscherichia coliZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The survival of Salmonella enterica within the intracellular host niche requires highly co-ordinated expression of virulence effectors predominantly regulated by the SsrAB two-component regulatory system. S. enterica serovar Typhimurium mutants lacking the ssrAB genes are avirulent in mice, highlighting the importance of this regulatory system in vivo. Mutants lacking the gene encoding the alternative sigma factor sigmaE (rpoE) are also highly attenuated for intracellular survival, pointing to a potential connection with the SsrAB regulatory system. RESULTS: In this study we demonstrate that RpoE is involved in fine-tuning the expression of a subset of SsrB-regulated genes found in the Salmonella pathogenicity island-2 (SPI-2) genetic locus that encodes a horizontally acquired type III secretion system, and unlinked genes integrated into this regulon that are required for virulence in host animals. CONCLUSION: These data point to a potential connection between the virulence phenotype of strains lacking ssrB and rpoE, and highlight new transcriptional regulation that might be essential for appropriate temporal and spatial control of the virulence-associated type III secretion system during host infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,390
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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