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Enregistrement W2080090371 · doi:10.4161/cc.10.11.15817

Genetic control of susceptibility to carcinogen-induced colorectal cancer in mice: The<i>Ccs3</i>and<i>Ccs5</i>loci regulate different aspects of tumorigenesis

2011· article· en· W2080090371 sur OpenAlexaff
Charles Meunier, Tony Kwan, Claire Turbide, Nicole Beauchemin, Philippe Gros

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyLocus (genetics)GeneticsCongenicAlleleColorectal cancerQuantitative trait locusCarcinogenesisGenePhenotypeGenetic predispositionCancer researchCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Colorectal cancer (CRC) is a multistep disease that involves a two-way interaction between a complex genetic pre-disposition component, and a set of poorly understood extrinsic environmental factors. In mice, CRC can be induced by treatment with azoxymethane (AOM). Using a set of AcB/BcA recombinant congenic strains derived from CRC-susceptible A/J and CRC-resistant C57Bl/6J (B6) progenitors, we previously detected the Ccs3 locus (colon cancer susceptibility locus 3) as a major regulator of CRC susceptibility. Phenotyping of additional AcB/BcA strains for susceptibility to AOM-induced CRC has refined the Ccs3 interval to a 6.7 Mb segment on chromosome 3. In addition, the presence of intermediate susceptibility phenotypes in individual AcB/BcA strains suggested additional gene effects regulating CRC susceptibility in A/J and B6 strains. Those were investigated by linkage analysis and whole genome scanning in a set of 208 informative (B6 x A/J)F2 progeny, using tumor multiplicity as a quantitative measure of susceptibility. This analysis validated the important role of Ccs3 in regulating this trait, and additionally detected contribution from a second locus on the distal portion of chromosome 9 (LOD = 3.76), that was given the temporary designation of Ccs5. Ccs5 modulates tumor multiplicity in F2 animals bearing at least one A/J-derived susceptibility allele at Ccs3, with A/J-derived Ccs5 susceptibility alleles being inherited in a recessive manner. There is a strong additive effect of Ccs3 and Ccs5 on tumor multiplicity in F2 mice: mice doubly homozygotes for A/J or B6 alleles at Ccs3 and Ccs5 show tumor numbers similar to those of parental A/J and B6, respectively. Interestingly, the Ccs5 region overlaps several quantitative trait loci previously reported to regulate intestinal homeostasis and susceptibility to intestinal colitis in mice and humans. Our findings identify a novel two-locus system regulating CRC susceptibility in mice, of which the relevance to human CRC can now be tested experimentally.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,230
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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