Association Between Genetic Variants in the<i>IL</i>-<i>23R</i>Gene and Early-Onset Crohn's Disease: Results From a Case-Control and Family-Based Study Among Canadian Children
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Interleukin (IL)-23 is a key regulator of inflammation and influences the activities of T-helper 17 (Th-17) lymphocytes. Recent reports indicate that variants in the gene coding for its receptor (IL-23R) are strongly associated with Crohn's disease (CD). We investigated whether DNA variants in the IL-23R gene determine susceptibility for CD in Canadian children. DESIGN AND METHODS: A case-control and case-parent trio design was implemented at three pediatric centers across Canada. Cases of CD (</=20 yr) along with their parents and controls were recruited. DNA samples were collected and genotyped for 10 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the IL-23R gene and three common SNPs in the CARD15 gene. Transmission disequilibrium-based tests were applied to the case-parent data and logistic regression models to the case-control data to study the association between the SNPs and CD. RESULTS: A total of 259 CD cases, 139 controls, and 232 families (167 trios and 65 dyads) were studied. The mean age at diagnosis was 13.3 yr (range 2.6-20 yr). The majority of the patients were Caucasian. Case-control analysis revealed significant associations with three SNPs (rs1004819, rs7517847, and rs11209026 [R381Q]) and borderline nonsignificant associations with three other SNPs (rs10489629, rs10889697, and rs11465804) in the IL-23R gene. Having any CARD15 variant was associated with a significant risk for CD (P < 0.0001). Analyses of case-parent data confirmed the findings from the case-control analysis including significant associations with the R381Q SNP (P= 0.002). The common variant in this SNP conferred risk for CD. These associations were largely independent of the CARD15 gene. CONCLUSIONS: Our findings confirm recently reported genome-wide associations between the IL-23R gene and CD. They suggest that the gene is also associated with pediatric-onset CD among Canadian children.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».