Analysis of an orf virus chemokine-binding protein: Shifting ligand specificities among a family of poxvirus viroceptors
Notice bibliographique
Résumé
We identify a secreted chemokine inhibitor encoded by orf virus (ORFV), the prototypic poxvirus of the Parapoxvirus genus, and show that it is related to the poxvirus type II CC-chemokine-binding proteins (CBP-II) produced by members of the Orthopoxvirus and Leporipoxvirus genera. The ORFV chemokine-binding protein (CBP) is functionally similar to the CBP-II proteins in its ability to bind and inhibit many CC-chemokines with high affinity. However, unlike CBP-II, the ORFV CBP also binds with high affinity to lymphotactin, a member of the C-chemokine family, demonstrating that the ORFV CBP possesses an altered binding specificity. Interestingly, the amino acid sequence of ORFV CBP more closely resembles the granulocyte-macrophage colony-stimulating factor/IL-2 inhibitory factor also produced by ORFV, implicating the granulocyte-macrophage colony-stimulating factor/IL-2 inhibitory factor protein as a highly diverged, but related, member of the CBP-II protein family. Notably, these findings suggest that the genes that encode these proteins derive from a common poxvirus ancestral gene that has since been modified in binding specificity during speciation of the poxvirus genera. Overall, these findings illustrate the concept of evolution of viral proteins at the biophysical and molecular interface.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».