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Enregistrement W2080263214 · doi:10.1021/ja076641c

Cholesterol Shows Preference for the Interior of Polyunsaturated Lipid Membranes

2007· article· en· W2080263214 sur OpenAlexaff
‪Siewert J. Marrink, Alex H. de Vries, Thad A. Harroun, John Katsaras, Stephen R. Wassall

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSterolChemistryPolyunsaturated fatty acidBilayerCholesterolMonolayerNeutron scatteringLipid bilayerPhospholipidMembraneScatteringFatty acidBiophysicsBiochemistryOpticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent neutron scattering experiments showed a striking manifestation of the aversion between polyunsaturated fatty acid (PUFA)-containing lipids and cholesterol. Selectively deuterated cholesterol/ 1,2-diarachidonylphosphatidylcholine (DAPC) samples revealed that the hydroxyl of the sterol resides at the center of the bilayer. Here we use a recently parametrized coarse grain simulation model to shed light on these puzzling experimental observations. Using a simulation setup in close correspondence to the experimental conditions, we reproduce the experimental neutron scattering profiles to a large extent. The simulations allow us to analyze the behavior of cholesterol in detail; we show that the interaction of cholesterol with the PUFA chains of DAPC leads to a fast flip-flop rate for the sterol and an increased preference of the sterol for the unusual location embedded between the monolayer leaflets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations207
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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