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Enregistrement W2080265915 · doi:10.2741/2835

Involvement of Dcr1 in post-transcriptional regulation of gene expression in Schizosaccharomyces pombe

2007· review· en· W2080265915 sur OpenAlexafffund
Lise-Andrée Gobeil

Notice bibliographique

RevueFrontiers in bioscience · 2007
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSchizosaccharomyces pombeDicerRibosome biogenesisGene expressionGeneBiologyRegulation of gene expressionGene silencingGeneticsTranscriptional regulationCell biologyRNARNA interferenceSaccharomyces cerevisiaeRibosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ribonuclease III Dicer (Dcr1) has been shown to be required for chromosome segregation and gene silencing in Schizosaccharomyces pombe. These effects are thought to be transcriptional, mediated by formation and maintenance of heterochromatin, and guided by small RNAs derived from Dcr1 along a process known as RNA interference. In order to get further insights into the gene regulatory role of Dcr1, we performed comparative analyses of dcr1 knockout and wild-type fission yeast strains. Analysis of part of the soluble proteomes identified eight cellular proteins whose expression is under Dcr1 control, three of which are integral constituents of the glycolysis pathway. Further correlations with their respective mRNA transcript levels are compatible with the existence of a post-transcriptional gene regulatory mechanism involving Dcr1 or a Dcr1 complex. Experiments designed to identify components of Dcr1 complexes unveiled two novel Dcr1 interactors, namely the zinc finger protein Byr3 and the ribosomal protein L12. Consistently enriched in Dcr1 immune complexes, Byr3 and L12 may link Dcr1 to the transcriptional and translational machineries, respectively, and contribute to post-transcriptional gene regulation in fission yeast.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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