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Enregistrement W2080315706 · doi:10.1155/2013/157547

Simultaneous Quantification of Mitochondrial DNA Damage and Copy Number in Circulating Blood: A Sensitive Approach to Systemic Oxidative Stress

2012· article· en· W2080315706 sur OpenAlexafffund
Sam W. Chan, Simone Chevalier, Armen Aprikian, Junjian Z. Chen

Notice bibliographique

RevueBioMed Research International · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanada Foundation for InnovationMcGill University
Mots-clésMitochondrial DNAOxidative stressDNA damageNuclear DNABiologyDNAOxidative damageMitochondrionOxidative phosphorylationMolecular biologyDNA repairImmunologyGeneticsBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Systemic oxidative stress is associated with a wide range of pathological conditions. Oxidative DNA damage is frequently measured in circulating lymphocytes. Mitochondrial DNA (mtDNA) is known to be more sensitive to oxidative damage than nuclear DNA but is rarely used for direct measurement of DNA damage in clinical studies. Based on the supercoiling-sensitive real-time PCR method, we propose a new approach for the noninvasive monitoring of systemic oxidative stress by quantifying the mtDNA structural damage and copy number change in isolated lymphocytes in a single test. We show that lymphocytes have significantly less mtDNA content and relatively lower baseline levels of damage than cancer cell lines. In an ex vivo challenge experiment, we demonstrate, for the first time, that exogenous H2O2 induces a significant increase in mtDNA damage in lymphocytes from healthy individuals, but no repair activity is observed after 1 h recovery. We further demonstrate that whole blood may serve as a convenient alternative to the isolated lymphocytes in mtDNA analysis. Thus, the blood analysis with the multiple mtDNA end-points proposed in the current study may provide a simple and sensitive test to interrogate the nature and extent of systemic oxidative stress for a broad spectrum of clinical investigations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,393

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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