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Enregistrement W2080330422 · doi:10.1186/ar4632

Targeting IRF5 inhibition in human B cells: identification of new functional roles that implicate IRF5 in systemic lupus erythematosus B-cell pathology

2014· article· en· W2080330422 sur OpenAlexfundno aff
Saurav De, Di Feng, Alisha Valdez, Amy Pitler, Betsy Barnes

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Arthritis NetworkNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesArthritis SocietyLupus Research AllianceNational Institutes of HealthLupus Foundation of AmericaCentral New York Community Foundation
Mots-clésIRF5RheumatologyMedicineB cellIdentification (biology)ImmunologyPathologyBioinformaticsInternal medicineBiologyInterferon regulatory factorsImmune systemAntibodyInnate immune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interferon regulatory factor 5 ( IRF5 ) systemic lupus erythematosus (SLE) risk loci is considered one of the most strongly and consistently associated SLE loci identified. It has been detected using both candidate gene and genome-wide association studies. Haplotypes are associated with increased, decreased, or neutral levels of risk for SLE and have been shown to associate with functional changes in IRF5-mediated signaling, including increased expression and elevated IFNα activity. The majority of studies, however, were performed in peripheral blood mononuclear cells and thus little is known of the function of IRF5 in specific human immune cell populations. We are interested in understanding the role of IRF5 in human B cells since previous studies in mice implicated a role for IRF5 in effector B-cell development and function and murine models of lupus lacking the Irf5 gene showed reduced ANA, glomerulonephritis and pathogenic autoantibody production. Unfortunately, many of these studies were complicated by the finding of a secondary mutation in the Dock2 gene amongst Irf5 mice. Recent findings from our laboratory indicate that IRF5 is constitutively localized to the nucleus of human SLE memory B cells and that activation of healthy donor B cells results in IRF5 nuclear localization, suggesting a functional role for IRF5 in human B cells. Human immortalized and primary B cells were utilized in this study. Primary naïve B cells were obtained by informed consent at University Hospital, Newark, NJ, USA under an approved IRB protocol, and either mock stimulated or stimulated with anti-IgM and CpG-B for activation. B-cell development, cytokine expression, autoantibody production and class switch recombination were examined in the presence or absence of siRNAs targeting IRF5 expression or peptide inhibitors targeting IRF5 nuclear localization. An IRF5-mediated B-cell signature was also examined under similar experimental conditions by ChIP-seq analysis. We find that IRF5 is indeed important for human B-cell effector functions, including, but not limited to, cytokine expression, differentiation, and autoantibody production, and have identified a pro-effector B cell gene program that is regulated by IRF5. These findings show for the first time that IRF5 is an important regulator of human effector B-cell development and function and thus, when overexpressed or overactivated, as seen in SLE B cells, would be expected to contribute significantly to SLE B-cell pathology. These data provide initial insight into how inhibitors of IRF5 activation may change SLE disease onset and/or progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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