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Enregistrement W2080347313 · doi:10.1126/science.1180614

Genome Project Standards in a New Era of Sequencing

2009· article· en· W2080347313 sur OpenAlexaff
Patrick Chain, Darren Grafham, Robert S. Fulton, Michael G. FitzGerald, Jessica B. Hostetler, Donna M. Muzny, Johar Ali, Bruce W. Birren, David Bruce, Christian Buhay, James R. Cole, Yan Ding, Shannon Dugan, Dawn Field, George M Garrity, Richard A. Gibbs, Tina Graves, Cliff Han, Scott H. Harrison, Sarah K. Highlander, Philip Hugenholtz, Hoda Khouri, Chinappa Kodira, Eugene Kolker, Nikos C. Kyrpides, Dorothy Lang, Alla Lapidus, Stephanie Malfatti, Victor Markowitz, T. Metha, William Nelson, Julian Parkhill, Sam Pitluck, Xiang Qin, Timothy D. Read, Jeremy Schmutz, Shanmuga Sozhamannan, Peter Sterk, R L Strausberg, Granger Sutton, Nicholas R. Thomson, J.M. Tiedje, George M. Weinstock, Aye Wollam, John C. Detter

Notice bibliographique

RevueScience · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNatural Environment Research CouncilSight Research UK
Mots-clésDNA sequencingWhole genome sequencingSequence (biology)Computational biologyData scienceBiologyGenomeGeneticsComputer scienceDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

More detailed sequence standards that keep up with revolutionary sequencing technologies will aid the research community in evaluating data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,084
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,117
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,916
Score d'incertitude au seuil0,442

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0840,117
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,007
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0050,009
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0040,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations404
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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