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Enregistrement W2080381436 · doi:10.1021/bp000098l

293SF Metabolic Flux Analysis during Cell Growth and Infection with an Adenoviral Vector

2000· article· en· W2080381436 sur OpenAlexaff
Isabelle Nadeau, Danielle Jacob, Pascal Perrier, Amine Kamen

Notice bibliographique

RevueBiotechnology Progress · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversité de MontréalPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlux (metallurgy)Metabolic flux analysisViral vectorVector (molecular biology)BiologyCellCell biologyVirologyChemistryMetabolismRecombinant DNAGeneticsBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolic flux quantification of cell culture is becoming a crucial means to improve cell growth as well as protein and vector productions. The technique allows rapid determination of cell culture status, thus providing a tool for further feeding improvements. Herein, we report on key results of a metabolic investigation using 293 cells adapted to suspension and serum-free medium (293SF) during growth and infection with an adenoviral vector encoding the green fluorescence protein (GFP). The model developed contains 35 fluxes, which include the main fluxes of glycolysis, glutaminolysis, and amino acids pathways. It requires specific consumption and production rate measurements of amino acids, glucose, lactate, NH(3), and O(2), as well as DNA and total proteins biosynthesis rate measurements. Also, it was found that extracellular protein concentration measurement is important for flux calculation accuracy. With this model, we are able to describe the 293SF cell metabolism, grown under different culture conditions in a 3-L controlled bioreactor for batch and fed-batch with low glucose. The metabolism is also investigated during infection under two different feeding strategies: a fed-batch starting at the end of the growth phase and extending during infection without medium change and a fed-batch after infection following medium renewal. Differences in metabolism are observed between growth and infection, as well as between the different feeding strategies, thus providing a better understanding of the general metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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