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Enregistrement W2080461000 · doi:10.1021/jp8023292

Amidicity Change as a Significant Driving Force and Thermodynamic Selection Rule of Transamidation Reactions. A Synergy between Experiment and Theory

2008· article· en· W2080461000 sur OpenAlexaff
Zoltán Mucsi, Gregory A. Chass, Imre G. Csizmadia

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity College of the North
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmideSelection (genetic algorithm)Amine gas treatingChemistryVariety (cybernetics)Biochemical engineeringProcess (computing)Computational chemistryCharacterization (materials science)Computer scienceNanotechnologyMaterials scienceOrganic chemistryArtificial intelligenceEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although essential in medicinal and industrial chemistry, transamidation reactions are still poorly understood mechanistically and in particular in terms of the extreme nature for their proceeding either very smoothly or not occurring at all. As yet, there exists no qualitative rule to predict the outcome of an amide interacting with an amine, with quantitative evaluations far from being established. In this paper we aim to clarify the thermodynamic selection rule and driving force of transamidation reactions based on amidicity value, measuring numerically the amide bond strength, toward providing a relatively simple protocol for practicing organic chemists to predict the outcome of an experiment. The change of amidicity over the course of a reaction made it possible to see that the process is favorable or unfavorable. This recently evaluated driving force of amidicity behaves analogously to the driving force of aromaticity in other organic reactions. This paper presents a successful comparison between empirical synthetic results and relevant computational characterizations, for a variety of transamidation reactions, all toward a synergy between experiments and theory. In this paper, we are re-examining experimentally and theoretically earlier experimental findings in relation to transamidation reactions and interpreting them from the aspect of amidicity change and stabilization enthalpies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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