<i>OCRL1</i> Mutations in Dent 2 Patients Suggest a Mechanism for Phenotypic Variability
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND/AIMS: Dent disease is an X-linked renal proximal tubulopathy associated with mutations in CLCN5 (Dent 1) or OCRL1 (Dent 2). OCRL1 mutations also cause the oculocerebrorenal syndrome of Lowe. METHODS: Dent patients with normal sequence for CLCN5 were sequenced for mutations in OCRL1. By analyzing these and all other OCRL1 mutations reported, a model relating OCRL1 mutations to the resulting disease (Dent 2 or Lowe's) was developed. RESULTS: Six boys with Dent disease had novel OCRL1 mutations: two missense (R301H, G304E) and four mutations predicted to produce premature termination codons (L56DfsX1, S149X, P161PfsX3, and M170IfsX1). These include one of the original patients reported by Dent and Friedman. Slit lamp examinations revealed early cataracts in only one boy with normal vision. None of these Dent 2 patients had metabolic acidosis; 3 had mild mental retardation. Analysis of all known OCRL1 mutations show that Dent 2 mutations fall into two classes that do not overlap with Lowe mutations. Bioinformatics analyses identified expressed OCRL1 splice variants that help explain the variability of those clinical features that distinguish Dent disease from Lowe syndrome. CONCLUSIONS: OCRL1 mutations can cause the renal phenotype of Dent disease, without acidosis or the dramatic eye abnormalities typical of Lowe syndrome. We propose a model to explain the phenotypic variability between Dent 2 and Lowe's based on distinctly different classes of mutations in OCRL1 producing splice variants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».