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Enregistrement W2080520842 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-14-0508

Polymorphisms of Asparaginase Pathway and Asparaginase-Related Complications in Children with Acute Lymphoblastic Leukemia

2014· article· en· W2080520842 sur OpenAlexaff
Mohsen Ben Tanfous, Bahram Sharif-Askari, Francesco Ceppi, Haithem Laaribi, Vincent Gagné, Julie Rousseau, Malgorzata Labuda, Lewis B. Silverman, Stephen E. Sallan, Donna Neuberg, Jeffery L. Kutok, Daniel Sinnett, Caroline Laverdière, Maja Krajinović

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Lymphoblastic Leukemia research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésAsparaginaseHaplotypeMedicineGenotypeAlleleAllergyImmunologyInternal medicinePancreatitisGastroenterologyLeukemiaOncologyBiologyGeneticsLymphoblastic LeukemiaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Asparaginase (ASNase) is a standard and critical component in the therapy of childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL), but it is also associated with several toxicities. EXPERIMENTAL DESIGN: We recently reported the results of an association study between ASNase pathway genes and event-free survival (EFS) in childhood patients with ALL. The same polymorphisms were interrogated here in relation to allergies, pancreatitis, and thrombotic events following treatment with E. coli ASNase. RESULTS: Among patients of the discovery group, allergies, and pancreatitis were more frequent in individuals who are homozygous for the triple-repeat allele (3R) of the asparagine synthetase (ASNS) gene, resulting in remarkably higher risk of these toxicities associated with 3R3R genotype [OR for allergies, 14.6; 95% confidence interval (CI), 3.6-58.7; P < 0.0005 and OR for pancreatitis, 8.6; 95% CI, 2.0-37.3; P = 0.01]. In contrast, the ASNS haplotype *1 harboring double-repeat (2R) allele had protective effect against these adverse reactions (P ≤ 0.01). The same haplotype was previously reported to confer reduction in EFS. The risk effect of 3R3R genotype was not replicated in the validation cohort, whereas the protective effect of haplotype *1 against allergies was maintained (P ≤ 0.002). Analysis with additional polymorphisms in ASNS locus in lymphoblastoid cell lines showed that haplotype *1 is diversified in several subtypes of which one was associated with reduced in vitro sensitivity to ASNase (rs10486009, P = 0.01) possibly explaining an association seen in clinical setting. CONCLUSIONS: This finding might have implication for treatment individualization in ALL and other cancers using asparagine depletion strategies. Clin Cancer Res; 21(2); 329-34. ©2014 AACR. See related commentary by Avramis, p. 230.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,866

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,350 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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