Gas‐phase fragmentation study of biotin reagents using electrospray ionization tandem mass spectrometry on a quadrupole orthogonal time‐of‐flight hybrid instrument
Notice bibliographique
Résumé
In this study, we evaluated, by electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) and collision-induced dissociation tandem mass spectrometry (CID-MS/MS) using a quadrupole orthogonal time-of-flight (QqToF)-MS/MS hybrid instrument, the gas-phase fragmentations of some commercially available biotinyl reagents. The biotin reagents used were: psoralen-BPE 1, p-diazobenzoyl biocytin (DBB) 2, photoreactive biotin 3, biotinyl-hexaethyleneglycol dimer 4, and the sulfo-SBED 5. The results showed that, during ESI-MS and CID-MS/MS analyses, the biotin reagents followed a similar gas-phase fragmentation pattern and the cleavages usually occurred at either end of the spacer arm of the biotin reagents. In general we have observed that the CID-MS/MS fragmentation routes of the five precursor protonated molecules obtained from the biotin linkers 1-5 afforded a series of product ions formed essentially by similar routes. The genesis and the structural identities of all the product ions obtained from the biotin linkers 1-5 have been assigned. All the exact mass assignments of the protonated molecules and the product ions were verified by conducting separate CID-MS/MS analysis of the deuterium-labelled precursor ions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».