Abstract 35: Novel genetic and clinical determinants of Constitutional Mismatch Repair Deficiency syndrome: Report from the CMMRD consortium
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: Constitutional mismatch repair deficiency (CMMRD) is a devastating cancer predisposition syndrome affecting children born with two mutated alleles in one of four mismatch repair genes. Data regarding clinical manifestations, molecular screening tools and management are limited. Patients and methods: We established an international CMMRD consortium and collected comprehensive clinical and genetic data. Molecular diagnosis of tumor and germline biospecimens were performed. A surveillance protocol was developed and implemented. Results: Overall, 27/30 (90%) of children with CMMR-D developed 48 different tumors. While childhood CMMR-D related tumors were observed in all families, Lynch related tumors in adults were observed in only 2/17 families (p<0.0001). All children with CMMR-D had cafe-au-lait spots and 14/17 families were consanguineous. We detected 17 different germline MMR mutations. These included mutations in PMS2(8), MSH6(7) and MLH1(2). Importantly 7/17 mutations were previously unreported. Brain tumors were the most common cancers reported (44%) followed by gastrointestinal (33%) and hematological malignancies (17%). Importantly, 14 (29%) of these were low grade and respectable cancers. Tumor immunohistochemistry was 100% sensitive and specific in diagnosing MMR deficiency of the corresponding gene while microsatellite instability was neither sensitive nor specific as a diagnostic tool (p<0.0001). Furthermore, screening of normal tissue by immunohistochemistry correlated with genetic confirmation of CMMR-D. The surveillance protocol detected 43 lesions which included asymptomatic malignant gliomas and gastrointestinal carcinomas. All tumors were amenable to complete resection and all patients undergoing surveillance are alive. Conclusion: CMMR-D is a highly penetrant syndrome where family history of cancer may not be contributory. Screening tumors and normal tissues using immunohistochemistry for abnormal expression of MMR gene products helps in diagnosis and early implementation of surveillance for these children. Citation Format: Doua Bakry, Brittany Campbell, Carol Durno, Melyssa Aronson, Qasim Alharbi, Musa Alharbi, Shlomi Constantini, Aaron Pollett, Shay Ben-Shachar, Jordan Lerner-Ellis, Steven Gallinger, Ronit Elhasid, Roula Farah, Ibrahim Qaddoumi, Matthew Mistry, Ramyar Lily, Steve Keiles, Rina Dvir, Derek Stephens, David Malkin, Eric Bouffet, Cynthia Hawkins, Uri Tabori. Novel genetic and clinical determinants of Constitutional Mismatch Repair Deficiency syndrome: Report from the CMMRD consortium. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Cancer Susceptibility and Cancer Susceptibility Syndromes; Jan 29-Feb 1, 2014; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(23 Suppl):Abstract nr 35. doi:10.1158/1538-7445.CANSUSC14-35
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».