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Enregistrement W2080621430 · doi:10.5551/jat.2451

A SNP of NPC1L1 Affects Cholesterol Absorption in Japanese

2010· article· en· W2080621430 sur OpenAlexaboutno aff
Tomomi Maeda, Akira Honda, Toshio Ishikawa, Makoto Kinoshita, Yamato Mashimo, Yoko Takeoka, Daijiro Yasuda, Jun Kusano, Kazuhisa Tsukamoto, Yasushi Matsuzaki, Tamio Teramoto

Notice bibliographique

RevueJournal of Atherosclerosis and Thrombosis · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLathosterolCampesterolEzetimibeCholesterolSingle-nucleotide polymorphismChemistryGenotypeInternal medicineAbsorption (acoustics)EndocrinologyBiologyBiochemistryMedicineSterolGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: Ezetimibe is known to target Niemann-Pick Type C1 Like1 (NPC1L1), a key protein in intestinal cholesterol absorption, and thus to decrease serum LDL-cholesterol (LDL-C) levels. The response of serum LDL-C levels to ezetimibe was reported to differe among NPC1L1 haplotypes.We analyzed NPC1L1 genotypes in Japanese and investigated differences in markers of cholesterol synthesis/absorption among the genotypes. METHODS: Blood samples were collected from 42 adult volunteers to measure markers of cholesterol synthesis (lathosterol) and absorption (sitosterol and campesterol) by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Based on a study by Hegele RA et al. in Canada, we selected three SNPs (1735 C>G, 25342 A>C and 27677 T>C (numbers relative to the transcription start site)) and analyzed them using PCR-RFLP. RESULTS: The frequencies of genotypes were as follows: 1735 C/G (46%)>C/C (35%)>G/G (19%), 25342 A/A (97%)>A/C (3%)>C/C (0%) and 27677 T/T (97%)>T/C (3%)>C/C (0%). Serum campesterol levels were significantly higher in the 1735 G/G group than 1735 C/G+C/C group, but lathosterol levels showed no significant differences between the genotypes. CONCLUSION: Our results revealed differences in the frequency of the NPC1L1 polymorphism between Japanese and Canadians. In Japanese, the 1735 G/G group showed enhanced cholesterol absorption from the intestine, as compared to the 1735 C/G+C/C group.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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