Gene expression profiles of normal proliferating and differentiating human intestinal epithelial cells: A comparison with the Caco-2 cell model
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
cDNA microarray technology enables detailed analysis of gene expression throughout complex processes such as differentiation. The aim of this study was to analyze the gene expression profile of normal human intestinal epithelial cells using cell models that recapitulate the crypt-villus axis of intestinal differentiation in comparison with the widely used Caco-2 cell model. cDNA microarrays (19,200 human genes) and a clustering algorithm were used to identify patterns of gene expression in the crypt-like proliferative HIEC and tsFHI cells, and villus epithelial cells as well as Caco-2/15 cells at two distinct stages of differentiation. Unsupervised hierarchical clustering analysis of global gene expression among the cell lines identified two branches: one for the HIEC cells versus a second comprised of two sub-groups: (a) the proliferative Caco-2 cells and (b) the differentiated Caco-2 cells and closely related villus epithelial cells. At the gene level, supervised hierarchical clustering with 272 differentially expressed genes revealed distinct expression patterns specific to each cell phenotype. We identified several upregulated genes that could lead to the identification of new regulatory pathways involved in cell differentiation and carcinogenesis. The combined use of microarray analysis and human intestinal cell models thus provides a powerful tool for establishing detailed gene expression profiles of proliferative to terminally differentiated intestinal cells. Furthermore, the molecular differences between the normal human intestinal cell models and Caco-2 cells clearly point out the strengths and limitations of this widely used experimental model for studying intestinal cell proliferation and differentiation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle