Stra13 Homodimers Repress Transcription through Class B E-box Elements
Notice bibliographique
Résumé
A mammalian basic helix-loop-helix protein known variably as Stra13, Sharp2, and Dec1 has been implicated in cell activation, proliferation, and differentiation. Indeed, Stra13 null mice develop age-induced autoimmunity as a result of impaired T-lymphocyte activation, leading ultimately to the accumulation of autoreactive T-cells and B-cells. Stra13 is expressed in embryonic as well as adult tissues derived from neuroectoderm, mesoderm, and endoderm and has been associated with response to hypoxia, suggesting a complex role for this protein and the highly related Sharp1/Dec2 protein in homeostatic regulation. Whereas Stra13 is known to regulate many important cellular functions and is known to cross-regulate biological responses to other basic helix-loop-helix containing transcription factors, including c-Myc and USF, it is unclear if this protein binds directly to DNA. Indeed, the basic domain of Stra13 contains a proline residue at an unprecedented position. Herein, we have determined that Stra13 binds with high affinity to CACGTG class B E-box elements as a homodimer with preference for elements preceded by T and/or followed by A residues. In addition, transient transfection experiments reveal that Stra13 represses transcription when bound to these and related sites. Our data suggest that Stra13 regulates cellular functions through antagonism of E-box activator proteins and also through active repression from E-box elements.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».