Purification and Characterization of Three Different Types of Bile Salt Hydrolases from Bifidobacterium Strains
Notice bibliographique
Résumé
Bile salt hydrolases were purified to electrophoretic homogeneity from Bifidobacterium bifidum ATCC 11863, Bifidobacterium infantis KL412, Bifidobacterium longum ATCC 15708, Bifidobacterium longum KL507, and Bifidobacterium longum KL515. Three different types (A, B, and C) of bile salt hydrolase (BSH) were revealed during the purification study, exhibiting the type-specific characteristics in their electrophoretic migration and elution profiles from anion exchange and hydrophobic interaction chromatographic columns. The subunit molecular mass estimated by sodium dodecylsulfate (SDS)-polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) was around 35 kDa, and the native molecular mass in all five Bifidobacterium strains was estimated to be between 130 and 150 kDa by gel filtration chromatography, indicating that all BSH enzymes have tetrameric structure. From the isoelectric focusing, an isoelectric point value of 4.45 was obtained with BSH (type B) from B. bifidum ATCC 11863 and the other BSH (types A and C) showed the similar pI values around 4.65. N-Terminal amino acid sequencing for the proteins of types A and C revealed that 6 out of 20 amino acid residues were different, and highly conserved residues were identified in both N-terminal sequences of types A and C. All BSH enzymes from five strains hydrolyzed six major human bile salts, and they showed a better deconjugation rate on glycine-conjugated bile salts than on taurine-conjugated forms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».