Liquid chromatographic/mass spectrometric detection of the 3‐(3‐hydroxyalkanoyloxy) alkanoic acid precursors of rhamnolipids in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> cultures
Notice bibliographique
Résumé
A series of pseudomolecular and fragment ions attributed to 3-(3-hydroxyalkanoyloxy)alkanoic acids (HAAs) were detected by liquid chromatography/mass spectrometry among the rhamnolipids observed in a Pseudomonas aeruginosa strain 57RP supernatant. The fragmentation mechanism leading to the formation of the fragment ions was determined by a deuterium exchange experiment and by using a standard HAA mixture obtained from the mild acidic hydrolysis of rhamnolipids of known composition. The structure and the response factor of these free HAAs were determined. The HAAs relative composition differs between free HAAs and those present in rhamnolipids, the former being enriched in lower molecular mass congeners and depleted in the heavier ones. Within an isomeric pair, the isomer with the shortest 3-hydroxyalkaloyl residue at the hydroxyl end was more abundant than the one with the heavier 3-hydroxyalkaloyl acid at this position, and the ratios of their relative abundances were similar for free HAAs and those in rhamnolipids. Experiments with deuterium-labeled rhamnolipids demonstrated that free HAAs are part of a pool used for rhamnolipid biosynthesis and are not rhamnolipid degradation products.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».