The effect of Brownian motion of fluorescent probes on measuring nanoscale distances by Förster resonance energy transfer
Notice bibliographique
Résumé
Förster resonance energy transfer (FRET) is a powerful optical technique to determine intra-molecular distances. However, the dye rotational motion and the linker flexibility complicate the relationship between the measured energy transfer efficiency and the distance between the anchoring points of the dyes. In this study, we present a simple model that describes the linker and dye dynamics as diffusion on a sphere. Single-pair energy transfer was treated in the weak excitation limit, photon statistics and scaffold flexibility were ignored, and different time-averaging regimes were considered. Despite the approximations, our model provides new insights for experimental designs and results interpretation in single-molecule FRET. Monte Carlo simulations produced distributions of the inter-dye distance, the dipole orientation factor, κ(2), and the transfer efficiency, E, which were in perfect agreement with independently derived theoretical functions. Contrary to common perceptions, our data show that longer linkers will actually restrict the motion of dye dipoles and hence worsen the isotropic 2∕3 approximation of κ(2). It is also found that the thermal motions of the dye-linker system cause fast and large efficiency fluctuations, as shown by the simulated FRET time-trajectories binned on a microsecond time scale. A fundamental resolution limit of single-molecule FRET measurements emerges around 1-10 μs, which should be considered for the interpretation of data recorded on such fast time scales.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».