Identification of signatory secondary metabolites during mycoparasitism of Rhizoctonia solani by Stachybotrys elegans
Notice bibliographique
Résumé
Stachybotrys elegans is able to parasitize the fungal plant pathogen Rhizoctonia solani AG-3 following a complex and intimate interaction, which, among others, includes the production of cell wall-degrading enzymes, intracellular colonization, and expression of pathogenic process encoding genes. However, information on the metabolome level is non-existent during mycoparasitism. Here, we performed a direct-infusion mass spectrometry (DIMS) metabolomics analysis using an LTQ Orbitrap analyzer in order to detect changes in the profiles of induced secondary metabolites of both partners during this mycoparasitic interaction 4 and 5 days following its establishment. The diketopiperazine(s) (DKPs) cyclo(S-Pro-S-Leu)/cyclo(S-Pro-S-Ile), ethyl 2-phenylacetate, and 3-nitro-4-hydroxybenzoic acid were detected as the primary response of Rhizoctonia 4 days following dual-culturing with Stachybotrys, whereas only the latter metabolite was up-regulated 1 day later. On the other hand, trichothecenes and atranones were mycoparasite-derived metabolites identified during mycoparasitism 4 and 5 days following dual-culturing. All the above secondary metabolites are known to exhibit bioactivity, including fungitoxicity, and represent key elements that determine the outcome of the interaction being studied. Results could be further exploited in programs for the evaluation of the bioactivity of these metabolites per se or their chemical analogs, and/or genetic engineering programs to obtain more efficient mycoparasite strains with improved efficacy and toxicological profiles.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».