Serum Susceptibility in Clinical Isolates of Burkholderia Cepacia Complex Bacteria: Development of a Growth-Based Assay for High Throughput Determination
Notice bibliographique
Résumé
Burkholderia cepacia complex (BCC) bacteria can cause devastating chronic infections in people with cystic fibrosis. Of particular concern is "cepacia syndrome," a rapidly progressive and usually fatal decline in health, characterized by a necrotizing bacteremic pneumonia. An important component of defense against bloodstream infections is the bactericidal action of serum. Traditional methods to determine the capacity of bacterial isolates to resist the bactericidal effects of serum are relatively low-throughput viability assays. In this study, we developed a novel growth-based assay for serum susceptibility, which allows for high throughput analysis. We applied this assay to a range of clinical isolates of BCC as well as isolates comprising the BCC experimental strain panel. Our data demonstrate that isolates from all species of BCC examined can possess serum resistant or serum sensitive/intermediate phenotypes. Of particular clinical significance, we also found no direct link between the last saved pulmonary isolate from patients who subsequently developed "cepacia syndrome" and their capacity to resist the inhibitory effects of human serum, suggesting serum resistance cannot be used as a marker of an isolate's capacity to escape from the lung and cause bacteremia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».