MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2081267474 · doi:10.1002/bip.10439

Vibrational circular dichroism and IR absorption of DNA complexes with Cu<sup>2+</sup> ions

2003· article· en· W2081267474 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiopolymers · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryGuanineCircular dichroismThymineCrystallographyCytosineIonVibrational circular dichroismMetalMetal ions in aqueous solutionAbsorption (acoustics)Absorption spectroscopyBase pairPhosphateStereochemistryDNANucleotideOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vibrational circular dichroism (VCD) spectroscopy and simultaneous IR absorption measurements are applied to study the interaction of natural calf thymus DNA with Cu2+ ions at room temperature in a Cu2+ concentration range of 0-0.4M (a Cu2+/phosphate molar ratio [Cu]/[P] of 0-0.7). In some important instances, VCD provides more detailed insights than previous IR investigations whereas in several others it leads to the same interpretations. The Cu2+ ions bind to phosphate groups at a low metal concentration. Upon increasing the ion concentration, chelates are formed in which Cu2+ binds to the N7 of guanine (G) and a phosphate group. Detectable only by VCD, significant distortion of most guanine-cytosine (GC) base pairs occurs at a [Cu]/[P] ratio of 0.5 with only a minor affect on adenine-thymine (AT) base pairs, which favors a "sandwich" complex in which a Cu2+ ion is inserted between two adjacent guanines in a GpG sequence. The AT base pairs become significantly distorted when the metal concentration is increased to 0.7 [Cu]/[P]. A number of GC base pairs, which are possibly involved in sandwich complexes, remain stacked and paired even at 0.7 [Cu]/[P], preventing complete strand separation. The DNA secondary structure changes considerably from the standard B-form geometry at a [Cu]/[P] ratio of 0.4 and higher. A further transition to some intermediate conformation that is inconsistent with either the A- or Z-form or a completely denatured state is suggested in agreement with other works. In general, VCD proves to be a reliable indicator of the 3-dimensional structure of the DNA-metal ion complexes, which reveals structural details that cannot be deduced from the IR absorption spectra alone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,450

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle