Detection of Microcystin-Producing Cyanobacteria in Missisquoi Bay, Quebec, Canada, Using Quantitative PCR
Notice bibliographique
Résumé
Toxic cyanobacterial blooms, as well as their increasing global occurrence, pose a serious threat to public health, domestic animals, and livestock. In Missisquoi Bay, Lake Champlain, public health advisories have been issued from 2001 to 2009, and local microcystin concentrations found in the lake water regularly exceeded the Canadian drinking water guideline of 1.5 microg liter(-1). A quantitative PCR (Q-PCR) approach was developed for the detection of blooms formed by microcystin-producing cyanobacteria. Primers were designed for the beta-ketoacyl synthase (mcyD(KS)) and the first dehydratase domain (mcyD(DH)) of the mcyD gene, involved in microcystin synthesis. The Q-PCR method was used to track the toxigenic cyanobacteria in Missisquoi Bay during the summers of 2006 and 2007. Two toxic bloom events were detected in 2006: more than 6.5 x 10(4) copies of the mcyD(KS) gene ml(-1) were detected in August, and an average of 4.0 x 10(4) copies ml(-1) were detected in September, when microcystin concentrations were more than 4 microg liter(-1) and approximately 2 microg liter(-1), respectively. Gene copy numbers and total microcystin concentrations (determined by enzyme-linked immunosorbent assay [ELISA]) were highly correlated in the littoral (r = 0.93, P < 0.001) and the pelagic station (r = 0.87, P < 0.001) in 2006. In contrast to the situation in 2006, a cyanobacterial bloom occurred only in late summer-early fall of 2007, reaching only 3 x 10(2) mcyD(KS) copies ml(-1), while the microcystin concentration was barely detectable. The Q-PCR method allowed the detection of microcystin-producing cyanobacteria when toxins and toxigenic cyanobacterial abundance were still below the limit of detection by high-pressure liquid chromatography (HPLC) and microscopy. Toxin gene copy numbers grew exponentially at a steady rate over a period of 7 weeks. Onshore winds selected for cells with a higher cell quota of microcystin. This technique could be an effective approach for the routine monitoring of the most at-risk water bodies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».