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Enregistrement W2081447030 · doi:10.1097/00000542-200308000-00011

Detection of a Novel Ryanodine Receptor Subtype 1 Mutation (R328W) in a Malignant Hyperthermia Family by Sequencing of a Leukocyte Transcript

2003· article· en· W2081447030 sur OpenAlexaffabout
Julian Loke, Natasha Kraev, Parveen Sharma, Guo-Guang Du, Leena Patel, Alexander Kraev, David H. MacLennan

Notice bibliographique

RevueAnesthesiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésRYR1Malignant hyperthermiaMutationRyanodine receptorGeneticsMutantMolecular biologyBiologyDNAGenePolymerase chain reactionPrimer (cosmetics)DNA sequencingInsertionMedicineChemistryReceptorPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: To determine whether malignant hyperthermia (MH) susceptibility in a Canadian pedigree is associated with a mutation in the ryanodine receptor subtype 1 (RYR1) gene, the complete RYR1 transcript obtained from the leukocytes of one MH-susceptible family member was sequenced, using a newly developed protocol. METHODS: RNA was extracted from leukocytes and converted into complementary DNA. Overlapping fragments of RYR1 complementary DNA were amplified by the polymerase chain reaction and used for double-strand sequencing to find a single mutation likely to be causal of MH susceptibility. Inheritance of the mutation in the family was studied by restriction endonuclease analysis and/or sequencing of genomic DNA and compared to available caffeine halothane contracture test data. The mutation was introduced into rabbit RYR1 complementary DNA, the complementary DNA was expressed in human embryonic kidney line 293 cells, and Ca2+ release by the mutant Ca2+ release channel was measured following the addition of caffeine and halothane. RESULTS: A novel arginine 328 to tryptophan mutation in RYR1 was detected by direct sequencing of the RYR1 transcript from leukocytes of one MH-susceptible individual. A causal role for this mutation in MH is indicated by cosegregation of the mutation with the MH-susceptible phenotype within the family and by the demonstration that the mutant channel has increased sensitivity to both caffeine and halothane. CONCLUSIONS: The feasibility of using complete RYR1 transcripts from leukocytes for sequence analysis offers an efficient and noninvasive method for scanning RYR1 for novel mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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