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Enregistrement W2081468475 · doi:10.1021/es703199g

Indirect Evidence of Transposon-Mediated Selection of Antibiotic Resistance Genes in Aquatic Systems at Low-Level Oxytetracycline Exposures

2008· article· en· W2081468475 sur OpenAlexaff
Charles W. Knapp, Christina A. Engemann, Mark L. Hanson, Patricia L. Keen, Kenneth J. Hall, David W. Graham

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Science & Technology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOxytetracyclineTetracycline16S ribosomal RNAGeneBiologyAntibioticsRibosomal RNAMicrobiologyBacteriaTetRTransposable elementAntibiotic resistanceGeneticsGene expressionMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Subinhibitory levels of antibiotics can promote the development of antibiotic resistance in bacteria. However, it is unclear whether antibiotic concentrations released into aquatic systems exert adequate pressure to select populations with resistance traits. To examine this issue, 15 mesocosms containing pristine surface water were treated with oxytetracycline (OTC) for 56 days at five levels (0, 5, 20, 50, and 250 microg L(-1)), and six tetracycline-resistance genes (tet(B), tet(L), tet(M), ted(O), tet(Q), and tet(W)), the sum of those genes (tet(R)), "total" 16S-rRNA genes, and transposons (Tn916 and Tn 1545) were monitored using real-time PCR. Absolute water-column resistance-gene abundances did not change at any OTC exposure. However, an increase was observed in the ratio of tet(R) to 16S-rRNA genes in the 250 microg L(-1) OTC units, and an increase in the selection rate of Tc(r) genes (relative to 16S-rRNA genes) was seen when OTC levels were at 20 microg L(-1). Furthermore, tet(M) and Tn916/1545 gene abundances correlated among all treatments (r2 = 0.701, p = 0.05), and there were similar selection patterns of tetR and Tn916/1545 genes relative to the OTC level, suggesting a possible mechanism for retention of specific resistance genes within the systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,006
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations128
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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