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Enregistrement W2081469258 · doi:10.1139/w09-008

Identification, characterization, and overexpression of a phytase with potential industrial interest

2009· article· en· W2081469258 sur OpenAlexvenueno aff
Xiaowei Shi, Minglv Sun, Bo Zhou, Xiaoyun Wang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytase and its Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhytaseAspergillus nigerPichia pastorisBiochemistryMolecular massBiologyAmino acidRecombinant DNAGlycosylationSignal peptideEnzymePeptide sequencePhytic acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A high phytase-producing strain of Aspergillus niger N-3 was identified by screening 104 microbial strains. The gene for A. niger N-3 was cloned and expressed in Pichia pastoris. The coding region without the introns and putative signal sequence was comprised of 1347 nucleotides. It encoded a polypeptide of 448 amino acids, exhibiting high amino acid sequence homologies (94.87%) with the typical phytase of A. niger NRRL 3135. The molecular mass of the recombinant phytase as determined by SDS-PAGE was 60-70 kDa, with maximum activity at approximately 55 degrees C (after incubation at 10 min). The phytase retained about 45% of its enzymatic activity under heat treatment at 90 degrees C for 5 min. It showed a greater affinity for sodium phytate than for p-nitrophenyl phosphate. Dual optima pH (2.0 and 5.5) was gained. The activity at pH 2.0 was about 30% higher than at pH 5.5, which was more suitable to the circumstance of the stomachs of monogastric animals. The extent of glycosylation influenced the characterization of phytase. The deglycosylated phytase showed pH optima at 3.5 and 5.5, and the molecular mass had dropped to 50 kDa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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