Crystallization and preliminary crystallographic studies of the catalytic subunits of human pyruvate dehydrogenase phosphatase isoforms 1 and 2
Notice bibliographique
Résumé
Pyruvate dehydrogenase phosphatase (PDP) is a mitochondrial serine phosphatase that activates phosphorylated pyruvate dehydrogenase complex by dephosphorylation. In humans, two PDP isoforms (1 and 2) have been identified. PDP1 is composed of a catalytic subunit (PDP1c) and a regulatory subunit (PDP1r), whereas PDP2 consists of only a catalytic subunit (PDP2c). Both PDP1c and PDP2c have been crystallized individually and complete X-ray diffraction data sets have been collected to 2.45 and 2.0 A resolution, respectively. The PDP1c crystals belonged to space group P4(1)2(1)2 or P4(3)2(1)2, with unit-cell parameters a = b = 65.1, c = 216.1 A. The asymmetric unit is expected to contain one molecule, with a Matthews coefficient V(M) of 2.56 A(3) Da(-1). The PDP2c crystals belonged to space group P2(1)2(1)2(1), with unit-cell parameters a = 53.6, b = 69.1, c = 109.7 A. The asymmetric unit is expected to contain one molecule, with a Matthews coefficient V(M) of 1.91 A(3) Da(-1).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».