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Enregistrement W2081503246 · doi:10.1111/j.1745-4581.2005.00024.x

CLOTH‐BASED HYBRIDIZATION ARRAY SYSTEM FOR DETECTION OF TOXIN GENES ASSOCIATED WITH MAJOR FOODBORNE PATHOGENIC BACTERIA

2005· article· en· W2081503246 sur OpenAlexaff
Martine Gauthier, Burton W. Blais

Notice bibliographique

RevueJournal of Rapid Methods & Automation in Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiologyBiologyAmpliconBacteriaVibrio choleraeSalmonellaToxinMultiplex polymerase chain reactionEnterotoxinEscherichia coliPolymerase chain reactionCholera toxinPathogenic bacteriaVibrioGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT A simple cloth‐based hybridization array system (CHAS) was developed for the identification of toxin genes associated with major foodborne pathogenic bacteria, including toxigenic Escherichia coli, Vibrio cholerae and Salmonella spp. Bacterial isolates were subjected to a multiplex polymerase chain reaction incorporating digoxigenin (DIG)–deoxyuridine triphosphate and primers targeting a variety of toxin genes (verotoxin, Salmonella enterotoxin, cholera toxin and heat‐labile/stable enterotoxin), followed by hybridization of the amplicons with an array of probes immobilized on polyester cloth and subsequent immunoenzymatic assay of the bound DIG label. This system provided sensitive and specific detection of the different target toxin gene markers in a variety of bacterial isolates, exhibiting the expected patterns of reactivity with a panel of bacteria having defined toxigenicity profiles. The CHAS is a cost‐effective tool facilitating the determination of the potential toxigenic profile of bacteria in the food microbiology laboratory, thus contributing valuable information to the risk‐assessment process in the microbiological analysis of foods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,556

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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