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Enregistrement W2081543488 · doi:10.4236/abb.2014.54046

Effect of the R406H Substitution on the Normal Function of CHEK2

2014· article· en· W2081543488 sur OpenAlexaff
Ahmet Yılmaz, Michael Davis, Weiqiang Zhao

Notice bibliographique

RevueAdvances in Bioscience and Biotechnology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCHEK2Checkpoint Kinase 2YeastBiologySaccharomyces cerevisiaeMutationComplementationGeneticsMutantWild typeDNA damageGeneCancer researchDNACell cycle checkpointCell cycleGermline mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CHEK2 (Checkpoint kinase homolog 2) encodes a protein involved in pathways that arrest the cell cycle in response to genomic stress such as DNA damage or replication blocks. Carriers of some of the CHEK2 mutations are at an increased risk of breast cancer. A mutation in the kinase domain of the CHEK2 gene resulting in the R406H substitution has been reported. However, it is currently unknown whether the substitution alters the function of CHEK2 in vitro. We evaluated the effect of the R406H substitution on the normal function of CHEK2 using a yeast complementation assay. The yeast cells lacking Rad53, the yeast homologue of human CHEK2 were transformed with the wild type as well as plasmids carrying mutations resulting in the R406H, 1100delC, and S428F variants. Yeast cells carrying the R406H variant grew at a rate similar to those carrying the wild type CHEK2, whereas the yeast carrying the S428F and 1100delC mutants grew at a slower rate. These results suggest that, unlike the well-known pathogenic alleles such as 1100delC and S428F, the R406H substitution does not abrogate the function of CHEK2. Therefore, this variant is probably not important in development of breast cancer in women.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,351

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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