Tribute to R. G. Boutilier: Evidence of a high activity carbonic anhydrase isozyme in the red blood cells of an ancient vertebrate, the sea lamprey <i>Petromyzon marinus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Carbonic anhydrase (CA) is a multi-functional enzyme that catalyzes the hydration/dehydration of carbon dioxide. In the red blood cell (rbc), CA is necessary to facilitate the transport of carbon dioxide out of the body. Results from earlier biochemical studies indicate that ancient vertebrates, such as agnathans, possess a low activity rbc CA isozyme, whereas more recently evolved vertebrates, such as teleost fish, possess a high activity isozyme. At present, however, the changes in the molecular structure that have resulted in this large increase in catalytic efficiency are unknown. The objective of the current study was therefore to determine the molecular structure of rbc CA in lampreys and compare it to that of teleosts in an effort to ascertain how this important enzyme became more efficient over evolutionary time. Isolation and sequencing of cytoplasmic CA from rbc and gill showed only a single isozyme of 789 bp (262 amino acids). This isozyme was also found in brain and kidney, with no evidence of additional cytoplasmic CA isozymes in other tissues. Phylogenetic analysis grouped this isozyme closely to vertebrate CA VII, which is ancestral to the rbc isozymes in other vertebrates. Interestingly, active site analysis revealed a structure similar to high activity isozymes. A comparative kinetic analysis of CA from rbc lysates and CA fusion proteins showed that the traditional method of determining the turnover number may not be appropriate for all vertebrate CAs. In contrast to previous evidence, lamprey CA was found to be a high activity isozyme. These results suggest that the critical functional characteristics of rbc CA have been highly conserved throughout vertebrate evolution.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,053 | 0,053 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».