Functional isolation of the <i>Candida albicans</i><i>FCR3</i> gene encoding a bZip transcription factor homologous to <i>Saccharomyces cerevisiae</i> Yap3p
Notice bibliographique
Résumé
We have isolated a C. albicans gene, named FCR3 (for fluconazole resistance 3), based upon its ability to suppress the FCZ hypersusceptibility of a Saccharomyces cerevisiae mutant strain (JY312) lacking the transcription factors Pdr1p and Pdr3p. The FCR3 ORF (1200 bp) encodes a 399 amino acid protein containing a basic leucine zipper (bZip) domain. Fcr3p displays the highest level of sequence homology with the S. cerevisiae Yap3p protein (34% identity, 45% similarity). We had previously shown that deletion of the PDR5 gene encoding a multidrug transporter completely abolished the ability of FCR3 to suppress the FCZ hypersusceptibility of JY312, suggesting that FCR3 confers FCZ resistance by activating PDR5 expression. We show here that the beta-galactosidase activity of a PDR5 promoter-lacZ construct in JY312 is increased two-fold upon FCR3 overexpression, demonstrating that FCR3 regulates PDR5 at the transcriptional level. We also show that FCR3 overexpression not only suppresses the hypersusceptibility of JY312 to 4-nitroquinoline-N-oxide (4-NQO) but also confers higher levels of resistance to this compound as compared to the wild-type KY320 strain. Since PDR5 is not involved in 4-NQO resistance, this result indicates that FCR3 can also activate the transcription of other genes that can confer 4-NQO resistance. Finally, Northern blot analysis indicates that FCR3 encodes a single 2.4 kb RNA transcript in C. albicans, suggesting that the FCR3 mRNA contains long 5' and/or 3' untranslated regions. The nucleotide sequence of the FCR3 gene has been deposited at GenBank under Accession No. AF342983.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».