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Enregistrement W2081788726 · doi:10.1387/ijdb.082820mg

Expression analysis and essential role of the putative tyrosine phosphatase His-domain-containing protein tyrosine phosphatase (HD-PTP)

2009· article· en· W2081788726 sur OpenAlexaff
Marie‐Claude Gingras, Dmitri Kharitidi, Valérie Chénard, Noriko Uetani, Maxime Bouchard, Michel L. Tremblay, Arnim Pause

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Developmental Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyProtein tyrosine phosphatasePhosphataseMolecular biologyGeneProtein phosphatase 2Locus (genetics)TyrosineGene expressionFusion proteinCell biologyPhosphorylationGeneticsBiochemistryRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The putative tyrosine phosphatase HD-PTP, encoded by the protein-tyrosine-phosphatase-n23 (Ptpn23) gene, has been described as a tumor suppressor candidate gene. However, its physiological roles and detailed expression profiles are poorly defined. To investigate HD-PTP functions, we generated a mouse model in which the Ptpn23 locus was disrupted by an in-frame insertion of a beta-galactosidase-neomycin-phosphotransferase II (beta-geo) cassette. This insertion leads to the expression of a catalytically inactive truncated protein preserving only the uncharacterized N-terminal BRO1-like domain in fusion with beta-geo under the control of the endogenous promoter. Here we report that homozygous gene deletion is lethal around embryonic day 9.5, suggesting that Ptpn23 is an essential requirement for early stages of embryonic development. Taking advantage of the beta-galactosidase insertion into the Ptpn23 locus, we define the precise Ptpn23 expression pattern by performing X-gal staining at different stages of mouse development. Our results show that Ptpn23 is expressed early during mouse development and that its expression is maintained in adult tissues, markedly in the epithelial cells of many organs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,517

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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