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Enregistrement W2081865619 · doi:10.1042/bj20090345

Interaction of anion exchanger 1 and glycophorin A in human erythroleukaemic K562 cells

2009· article· en· W2081865619 sur OpenAlexaff
Allison Pang, Reinhart A.F. Reithmeier

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycophorinBand 3Ion exchangeChemistryAnion exchangerIonBiophysicsBiochemistryBiologyMembraneMembrane proteinOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AE1 [anion exchanger 1, also known as SLC4A1 (solute carrier family 4, anion exchanger, member 1) and band 3 (erythrocyte membrane protein band 3)] is a major membrane glycoprotein expressed in human erythrocytes where it mediates the exchange of chloride and bicarbonate across the plasma membrane. Glycophorin A (GPA) is a sialoglycoprotein that associates with AE1 in erythrocytes forming the Wrb (Wright b) blood group antigen. These two integral proteins may also form a complex during biosynthesis, with GPA facilitating the cell surface expression of AE1. This study investigates the interaction of GPA with AE1 in K562 cells, a human erythroleukaemic cell line that expresses GPA, and the role of GPA in the cell surface expression of AE1. In K562 cells, GPA was dimeric and N- and O-glycosylated similar to erythroid GPA. GPA was localized at the cell surface, but also localized to the Golgi. AE1 expressed in K562 cells contained both complex and high-mannose oligosaccharides, and co-localized with GPA at the cell surface and in the endoplasmic reticulum (ER). The Wrb antigen was detected at the cell surface of AE1-transfected K562 cells, indicating the existence of an AE1-GPA complex. Immunofluorescence and co-immunoprecipitation studies using AE1 and an ER-localized hereditary spherocytosis mutant (R760Q AE1) showed that GPA and AE1 could interact in the ER. GPA knockdown by shRNAs (small-hairpin RNAs), however, had no effect on the level of cell surface expression of AE1. The results indicate that AE1 and GPA form a complex in the ER of human K562 cells, but that both proteins can also traffic to the cell surface independently of each other.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,282

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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