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Enregistrement W2081994681 · doi:10.1164/rccm.201003-0351oc

Genetic Variation in the <i>FAS</i> Gene and Associations with Acute Lung Injury

2010· article· en· W2081994681 sur OpenAlexaff
Bradford J. Glavan, Tarah D. Holden, Christopher H. Goss, R. Anthony Black, Margaret J. Neff, Avery B. Nathens, Thomas R. Martin, Mark M. Wurfel

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory and Critical Care Medicine · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineHaplotypeSingle-nucleotide polymorphismFas receptorImmunologyFas ligandGenetic predispositionGenotypeCase-control studyGenetic variationInternal medicineApoptosisGeneProgrammed cell deathBiologyGeneticsPopulationDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RATIONALE: Fas (CD95) modulates apoptosis and inflammation and is believed to play an important role in lung injury. OBJECTIVES: To determine if common genetic variation in FAS is associated with acute lung injury (ALI) susceptibility, risk of death, and FAS gene expression. METHODS: We genotyped 14 single nucleotide polymorphisms (tagSNPS) in FAS in samples from healthy white volunteers (control subjects, n = 294) and patients with ALI (cases, n = 324) from the ARDSnet Fluid and Catheter Treatment Trial (FACTT). FAS genotypes associated with ALI in the discovery study were confirmed in a nested case-control validation study of critically ill patients at risk for ALI (n = 657). We also tested for associations between selected tagSNPS and FAS mRNA levels in whole blood from healthy control subjects exposed to media alone or LPS ex vivo. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: We identified associations between four tagSNPs in FAS (FAS(-11341A>T) [rs17447140], FAS(9325G>A) [rs2147420], FAS(21541C>T) [rs2234978], and FAS(24484A>T) [rs1051070]) and ALI case status. Haplotype-based analyses suggested that three of the tagSNPs (FAS(9325G>A), FAS(21541C>T), and FAS(24484A>T)) function as a unit. The association with this haplotype and ALI was validated in a nested case-control study of at-risk subjects (P = 0.05). This haplotype was also associated with increased FAS mRNA levels in response to LPS stimulation. There was no association between FAS polymorphisms and risk of death among ALI cases. CONCLUSIONS: Common genetic variants in FAS are associated with ALI susceptibility. This is the first genetic evidence supporting a role for FAS in ALI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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