Concurrent Analysis of Nose and Groin Swab Specimens by the IDI-MRSA PCR Assay Is Comparable to Analysis by Individual-Specimen PCR and Routine Culture Assays for Detection of Colonization by Methicillin-Resistant <i>Staphylococcus aureus</i>
Notice bibliographique
Résumé
The IDI-MRSA assay (Infectio Diagnostic, Inc., Sainte-Foy, Quebec, Canada) with the Smart Cycler II rapid DNA amplification system (Cepheid, Sunnyvale, CA) appears to be sensitive and specific for the rapid detection of nasal colonization by methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). We assessed the sensitivity and specificity of this assay under conditions in which both the nose and cutaneous groin specimens were analyzed together and compared the accuracy of this PCR approach to that when these specimens were tested separately and by culture assays in an inpatient population with known high rates (12 to 15%) of MRSA colonization. Of 211 patients screened, 192 had results assessable by all three methods (agar-broth culture, separate nose and groin IDI-MRSA assay, and combined nose-groin IDI-MRSA assay), with MRSA carriage noted in 31/192 (16.1%), 41/192 (21.4%), and 36/192 (18.8%) patients by each method, respectively. Compared to agar culture results, the sensitivity and specificity of the combined nose-groin IDI-MRSA assay were 88.0% and 91.6%, respectively, whereas when each specimen was processed separately, the sensitivities were 90.0% (nose) and 83.3% (groin) and the specificities were 91.7% (nose) and 90.2% (groin). IDI-MRSA assay of a combined nose-groin specimen appears to have an accuracy similar to that of the current recommended PCR protocol, providing results in a clinically useful time frame, and may represent a more cost-effective approach to using this assay for screening for MRSA colonization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».