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Enregistrement W2082162812 · doi:10.3109/08916934.2014.914505

Association study of<i>interleukin-19 rs2243188</i>polymorphism with systemic lupus erythematosus in a Chinese population

2014· article· en· W2082162812 sur OpenAlexaff
Jing Ni, Min Zhang, Yan Zhu, Gui-Mei Chen, Juan Liu, Chao Zhang, Lian‐Ju Li, Hai‐Feng Pan, Dong‐Qing Ye

Notice bibliographique

RevueAutoimmunity · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensInstitute of Population and Public Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeSingle-nucleotide polymorphismAlleleGenotypingMinor allele frequencyLupus nephritisInternal medicineImmunologyAllele frequencySNPMedicineTaqManPolymorphism (computer science)PopulationGastroenterologyBiologyGeneticsPolymerase chain reactionGeneDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The purpose of this study was to evaluate whether a single-nucleotide polymorphism (SNP), rs2243188 of interleukin-19 (IL-19), show significant evidence for association with SLE in a Chinese population. A total of 545 SLE patients and 613 healthy controls were collected in the present study. The genotyping of IL-19 rs2243188 polymorphism was detected by TaqMan allele discrimination assay on the 7300 real time polymorphism chain reaction system. The minor C allele of rs2243188, relative to the major A allele, appeared to have a significantly lower frequency in SLE patients (31.0%) as compared with controls (35.5%) (χ(2) = 5.19, p = 0.023). We also discovered a statistical significance in the dominant model (CC + CA versus AA: OR = 0.755, 95% CI = 0.598-0.953, p = 0.018). However, no significant difference in genotype distribution was found between SLE patients and controls (p = 0.056). Furthermore, an increased frequency of CC genotype were also detected in lupus nephritis (LN) groups as compared with non-LN groups (p = 0.024). Besides, the individuals with CC genotype had a 2.201-fold higher risk for the susceptibility to LN than those A allele carriers (AA + CA) (p = 0.006). Unfortunately, the analyses on the relationship of IL-19 rs2243188 with several clinical manifestations of SLE failed to find any significant results. In conclusion, our observations suggested the minor C allele of SNP rs2243188 might be a protective factor for SLE in a Chinese Han population. Moreover, the subgroup analysis highlighted that IL-19 rs2243188 SNP was associated with the susceptibility to LN patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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