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Enregistrement W2082458892 · doi:10.1002/gepi.21771

Identification of New Genetic Susceptibility Loci for Breast Cancer Through Consideration of Gene‐Environment Interactions

2013· article· en· W2082458892 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenetic Epidemiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversité du QuébecUniversité LavalUniversity Health NetworkMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteOccupational Cancer Research CentreCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfInstituto de Salud Carlos IIIMedical Research CouncilRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnNational Health and Medical Research CouncilInstitut National Du CancerCancer Council VictoriaDeutsche KrebshilfeMedical Research and Materiel CommandAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailVetenskapsrådetNational Cancer InstituteKuopion Yliopistollinen SairaalaCancer Research UKHerlev HospitalNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekCHIST-ERAAgence Nationale de la RechercheRobert Bosch StiftungAgency for Science, Technology and ResearchCanadian Institutes of Health ResearchCancerfondenOvarian Cancer Research FundCancer AustraliaNational Breast Cancer FoundationBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchNational Institutes of HealthDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationLigue Contre le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumCancer Care OntarioGénome QuébecMcGill UniversityFondation de FranceSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådItä-Suomen YliopistoU.S. Department of Health and Human ServicesBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésIdentification (biology)GeneticsBreast cancerBiologyGeneComputational biologyCancerEvolutionary biologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genes that alter disease risk only in combination with certain environmental exposures may not be detected in genetic association analysis. By using methods accounting for gene-environment (G × E) interaction, we aimed to identify novel genetic loci associated with breast cancer risk. Up to 34,475 cases and 34,786 controls of European ancestry from up to 23 studies in the Breast Cancer Association Consortium were included. Overall, 71,527 single nucleotide polymorphisms (SNPs), enriched for association with breast cancer, were tested for interaction with 10 environmental risk factors using three recently proposed hybrid methods and a joint test of association and interaction. Analyses were adjusted for age, study, population stratification, and confounding factors as applicable. Three SNPs in two independent loci showed statistically significant association: SNPs rs10483028 and rs2242714 in perfect linkage disequilibrium on chromosome 21 and rs12197388 in ARID1B on chromosome 6. While rs12197388 was identified using the joint test with parity and with age at menarche (P-values = 3 × 10(-07)), the variants on chromosome 21 q22.12, which showed interaction with adult body mass index (BMI) in 8,891 postmenopausal women, were identified by all methods applied. SNP rs10483028 was associated with breast cancer in women with a BMI below 25 kg/m(2) (OR = 1.26, 95% CI 1.15-1.38) but not in women with a BMI of 30 kg/m(2) or higher (OR = 0.89, 95% CI 0.72-1.11, P for interaction = 3.2 × 10(-05)). Our findings confirm comparable power of the recent methods for detecting G × E interaction and the utility of using G × E interaction analyses to identify new susceptibility loci.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,462
Score d'incertitude au seuil0,628

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle