Analysis of the PTEN gene mutation in polyposis syndromes and sporadic gastrointestinal tumors in Japanese patients
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: PTEN is a candidate tumor suppressor gene for mutations which are responsible for Cowden disease. Recently, it has been shown that PTEN is mutated in several human neoplasms. To investigate the role of PTEN in tumorigenesis, we screened its mutation in Japanese patients with gastrointestinal polyposis and various sporadic tumors. METHODS: The entire coding region of PTEN was screened by single strand conformational polymorphism or direct sequencing for somatic mutations in 16 gingival papillomas, 4 juvenile polyps, 10 esophageal papillomas, and 20 colorectal cancers and for germline mutations in three patients with Cowden disease (including one with Lhermitte-Duclos disease) and one patient each with juvenile polyposis syndrome, Turcot's syndrome, and Cronkhite-Canada syndrome. RESULTS: Germline mutations were found in all cases of Cowden disease. One mutation was a nonsense mutation at codon 130 (CGA-->TGA), and the other two were splice site mutations at the 5' site of intron 4 and the 3' site of intron 8. We could not detect germline mutations in other patients with gastrointestinal polyposis or somatic mutations in sporadic tumors. CONCLUSIONS: We confirmed previous reports that germline mutations in PTEN are responsible for Cowden disease. However, somatic mutations of PTEN may not play a major role in tumorigenesis, at least in colorectal cancers, esophageal papillomas and gingival papillomas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».