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Enregistrement W2082657879 · doi:10.1038/mp.2013.86

ATP5H/KCTD2 locus is associated with Alzheimer's disease risk

2013· review· en· W2082657879 sur OpenAlexfundno aff
Merçé Boada, Carmen Antúnez, Reposo Ramírez‐Lorca, Anita L. DeStefano, Antonio González‐Pérez, Javier Gayán, Jesús López‐Arrieta, M. Arfan Ikram, Isabel Hernández, Juan Marín, José Jorge Galán, Joshua C. Bis, Ana Mauleón, Maitée Rosende‐Roca, Concha Moreno‐Rey, Vilmundur Gudnasson, Francisco Jesús Morón, Juan Velasco, José Miguel Carrasco, Montserrat Alegret, Ana Espinosa, Georgina Vinyes, A. Lafuente, Liliana Vargas, Annette L. Fitzpatrick, Lenore J. Launer, María Eugenia Sáez, Enrique Vázquez, James T. Becker, Oscar L. López, Manuel Serrano‐Ríos, Lluís Tárraga, Cornelia M. van Duijn, Luís Miguel Real, Sudha Seshadri, Agustı́n Ruiz

Notice bibliographique

RevueMolecular Psychiatry · 2013
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of California, San DiegoUniversity of California, Los AngelesNational Institutes of HealthNational Institute on AgingCentro de Investigación Biomédica en Red sobre Enfermedades NeurodegenerativasCanadian Institutes of Health ResearchDana FoundationNorthern California Institute for Research and EducationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismLocus (genetics)GenotypingGeneticsBiologyGenetic associationAlzheimer's diseaseGenotypeDiseaseMedicineInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To identify loci associated with Alzheimer disease, we conducted a three-stage analysis using existing genome-wide association studies (GWAS) and genotyping in a new sample. In Stage I, all suggestive single-nucleotide polymorphisms (at P<0.001) in a previously reported GWAS of seven independent studies (8082 Alzheimer's disease (AD) cases; 12 040 controls) were selected, and in Stage II these were examined in an in silico analysis within the Cohorts for Heart and Aging Research in Genomic Epidemiology consortium GWAS (1367 cases and 12904 controls). Six novel signals reaching P<5 × 10(-6) were genotyped in an independent Stage III sample (the Fundació ACE data set) of 2200 sporadic AD patients and 2301 controls. We identified a novel association with AD in the adenosine triphosphate (ATP) synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 (ATP5H)/Potassium channel tetramerization domain-containing protein 2 (KCTD2) locus, which reached genome-wide significance in the combined discovery and genotyping sample (rs11870474, odds ratio (OR)=1.58, P=2.6 × 10(-7) in discovery and OR=1.43, P=0.004 in Fundació ACE data set; combined OR=1.53, P=4.7 × 10(-9)). This ATP5H/KCTD2 locus has an important function in mitochondrial energy production and neuronal hyperpolarization during cellular stress conditions, such as hypoxia or glucose deprivation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,897
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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