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Enregistrement W2082667125 · doi:10.1074/jbc.m406458200

Self-interacting Domains in the C Terminus of a Cation-Cl- Cotransporter Described for the First Time

2004· article· en· W2082667125 sur OpenAlexaff
Charles F. Simard, Geneviève M. Brunet, Nikolas D. Daigle, Valérie Montminy, Luc Caron, Paul Isenring

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCotransporterChemistryBiophysicsBiologySodiumOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The first isoform of the Na+-K+-Cl- cotransporter (NKCC1), a widely distributed member of the cation-Cl- cotransporter superfamily, plays key roles in many physiological processes by regulating the ion and water content of animal cells and by sustaining electrolyte secretion across various epithelia. Indirect studies have led to the prediction that NKCC1 operates as a dimer assembled through binding domains that are distal to the amino portion of the carrier. In this study, evidence is presented that NKCC1 possesses self-interacting properties that result in the formation of a large complex between the proximal and the distal segment of the cytosolic C terminus. Elaborate mapping studies of these segments showed that the contact sites are dispersed along the entire C terminus, and they also led to the identification of a critical interacting residue that belongs to a putative forkhead-associated binding domain. In conjunction with previous findings, our results indicate that the uncovered interacting domains are probably a major determinant of the NKCC1 conformational landscape and assembly into a high order structure. A model is proposed in which the carrier could alternate between monomeric and homo-oligomeric units via chemical- or ligand-dependent changes in conformational dynamics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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