Mediators of receptor tyrosine kinase activation in infantile fibrosarcoma: a Children's Oncology Group study
Notice bibliographique
Résumé
Infantile fibrosarcoma (IFS; also known as cellular congenital mesoblastic nephroma, CMN, when in the kidney) is a rare, undifferentiated tumour often characterized by the ETV6-NTRK3 fusion transcript. Our goal was to identify downstream pathways, diagnostic markers and potential therapeutic targets for IFS/CMN. Global gene expression, reverse-phase protein array and ETV6-NTRK3 fusion analyses were performed on 14 IFS/CMN and compared with 41 other paediatric renal tumours. These analyses confirm significant receptor tyrosine kinase (RTK) activation, with evidence of PI3-Akt, MAPK and SRC activation. In particular, GAB2 docking protein, STAT5-pTyr-694, STAT3-pSer-729 and YAP-pSer-127 were elevated, and TAZ-pSer-89 was decreased. This provides mRNA and proteomic evidence that GAB2, STAT activation and phosphorylation of the Hippo pathway transcription co-activators YAP and TAZ contribute to the RTK signal transduction in IFS/CMN. All IFS/CMN tumours displayed a distinctive gene expression pattern that may be diagnostically useful. Unexpectedly, abundant ETV6-NTRK3 transcript copies were present in only 7/14 IFS, with very low copy number in 3/14. An additional 4/14 were negative by RT-PCR and absence of ETV6-NTRK3 was confirmed by FISH for both ETV6 and NTRK3. Therefore, molecular mechanisms other than ETV6-NTRK3 fusion are responsible for the development of some IFS/CMNs and the absence of ETV6-NTRK3 fusion products should not exclude IFS/CMN as a diagnosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».