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Enregistrement W2082932208 · doi:10.1139/v07-006

Biradical radiationless decay channel in adenine and its derivatives

2007· article· en· W2082932208 sur OpenAlexvenueno aff
Marek Z. Zgierski, Serguei Patchkovskii, Edward C. Lim

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryUnpaired electronExcited stateGround stateInternal conversionRing (chemistry)Ab initioNucleobaseTriplet stateAtomic physicsComputational chemistryCrystallographyElectronMoleculeDNAPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coupled-cluster calculations of increasing accuracy (approximate doubles: CC2; doubles: EOM-CCSD; connected triples: CR-EOM-CCSD(T)) for CIS-optimized potential energy profiles of adenine and its derivatives indicate that the ultrafast internal conversion of the optically excited π π* state occurs through a state switch to a biradical state, which intersects the ground state at a lower energy. The electronic nature of the biradical state is defined by an electronic configuration in which one unpaired electron occupies a π* orbital confined to the five-membered ring. The second unpaired electron is localized very strongly on a p-type C2 atomic orbital of the six-membered ring. The biradical state minimum has a strongly puckered six-membered ring and a C2–H bond, which is twisted nearly perpendicular to the average ring plane. Consistent with the biradical-mediated internal conversion, the π π* state lifetime is extremely short in adenine and 9-methyladenine, which have barrierless crossing to the biradical state. The lifetime is slightly longer in N,N-dimethyladenine, which has a small barrier for the state switch. In 2-aminopurine the biradical state is found above the π π* state, preventing the biradical state switch and dramatically increasing the lifetime. These results, combined with an earlier work on pyrimidine bases, strongly suggest the importance of a direct decay of the doorway π π* state via a biradical state switch in the photophysics of DNA, even though the nature of the biradical state is somewhat different in purines and pyrimidines.Key words: adenine, guanine, DNA damage, radiationless decay, biradical, ab initio, coupled clusted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,488

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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