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Enregistrement W2082944689 · doi:10.3732/apps.1400057

Microsatellite primers for <i>Camissoniopsis cheiranthifolia</i> (Onagraceae) and cross‐amplification in related species

2014· article· en· W2082944689 sur OpenAlexafffund
Adriana López‐Villalobos, Karen E. Samis, Christopher G. Eckert

Notice bibliographique

RevueApplications in Plant Sciences · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward IslandQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaSan Diego State University
Mots-clésBiologyMicrosatelliteLocus (genetics)Mating systemPopulationZoologyTaxonEvolutionary biologyAlleleGeneticsMatingBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PREMISE OF THE STUDY: We developed 24 nuclear microsatellite primers from an enriched genomic library for the Pacific coastal dune endemic Camissoniopsis cheiranthifolia to study the consequences of mating system differentiation, the genetics of species' range limits, and hybridization with its closest sister taxon, C. bistorta. • METHODS AND RESULTS: Twenty-four primer pairs were developed and characterized in four populations of C. cheiranthifolia and one population of C. bistorta. We also tested eight additional taxa for cross-amplification. The average number of alleles per locus per species was 4.3 and 6.0, respectively. The number of loci that amplified and were variable within the eight related taxa ranged from six to 17. • CONCLUSIONS: These markers will be useful in studying mating system evolution, the genetic structure of species' ranges, hybridization, and the provenance of material used for habitat restoration in C. cheiranthifolia, C. bistorta, and related species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,281
Score d'incertitude au seuil0,280

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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